O mel que tem um nível mais alto de MGO e propriedades anti-sépticas mais potentes é usado para fins médicos. Pode ajudar no tratamento de feridas, problemas digestivos, tosse, dor de garganta e acne.Estes problemas são causados principalmente por microorganismos patogénicosÉ por isso que as propriedades antibacterianas do mel de Manuka podem ajudar no tratamento.